据审计署网站信息，2013年12月至2014年3月，审计署对国家税务总2013年度预算执行状况和其它财政收入状况实现了财务审计，关键财务审计了局区级和隶属机关单位服务局、税款科学合理研究室等5个企业，并对相关事宜开展了拓宽财务审计。审计数据显示，截止到2013年底，国家税务总局区级超定编配置公务用车20辆，超标配置公务用车30辆。

　　国家税务总为中央预算一级预算单位，财政预算由局区级和42个二级预算单位的费用预算构成。国家财政部审批国家税务总2013年度单位财政拨款预算支出为 6149105.75万余元(含政府性基金费用预算，相同)，国家税务总预算(议案)体现的当初财政拨款开支5478388.99万余元，其财政预算与实行結果的差别总金额为670716.76万余元。

　　此次财务审计国家税务总区级及所在单位2013年度财政拨款开支总共378639.20万余元，占单位财政拨款开支总金额的6.16%。财务审计查出来预算执行中不符金融规章制度要求的问题额度11638.52万余元，在其中2013年11524.81万余元;别的财政收入层面不符金融规章制度要求的问题额度140.57万余元。以上问题对国家税务总2013年度预算执行結果的危害见附注2。

　　财务审计结果显示，国家税务总和此次财务审计的所在单位2013年度预算执行基本上遵循预算法及有关法律法规，依照会计准则及相关要求的标准开展财务会计解决，加强财务会计和内部审计监管，进一步完善了国税局系统软件经费预算管理方法有关规章制度。

　　财务审计发觉预算执行中存在的问题，一是截止到2013年底，局区级超定编配置公务用车20辆，超标配置公务用车30辆。

　　二是2012年至2013年，隶属税款科学合理研究室没经准许在新项目经费预算中税前列支工作人员经费预算153.42万余元，在其中2013年39.71万余元。

　　三是2013年，隶属机关单位服务局没经政府部门采购，立即与一企业签署机器设备运作维修合同，涉及到额度109.81万余元;截止到2013年底，河北省、山西省、黑龙江省三省税务局普票印刷未按照规定推行招投标，2013年印刷税票100 373.8万分、开支11 025.29万余元。

　　四是2013年，安徽省国税局在其机构学习培训的有关成本已由各县市区税务局付款的情形下，虚开发票培训费用单据，向国家税务总领取培训费用350万余元，储放于所在的3家培训学校。

　　五是局区级从2006年起逐渐基本建设“资产和行为税税务稽查监控管理平台”新项目，共获得财政局项目资金5230万余元，但至2013年底并未构建起有关数据库查询，资产结转成本1102.47万余元。

　　财务审计发觉别的财政收入中存在的问题，2013年，局区级应用不合规管理单据费用报销140.57万余元。

　　对以上问题，审计署已依规出示了财务审计报告、下发了财务审计认定书。财务审计发觉有关因涉嫌违法乱纪事宜，已移交相关部门进一步调研解决。对超定编、超标配置公务用车问题，规定按照规定开展解决;对没经准许调济应用存量资金问题，规定将来严格执行要求实行;对未严格遵守政府部门采购方案问题，规定严格遵守有关要求;对虚开发票单据领取培训费用问题，规定按实拨款培训费用到底层税务部门;对税务稽查监控管理平台基本建设迟缓问题，规定积极推进监控管理平台基本建设;对应用不合规管理税票费用报销问题，规定将来严格遵守有关要求。对于财务审计发觉的问题，审计署提议：国家税务总进一步提高费用预算填报的严谨性和精确性，严苛国税局系统软件“三公”经费预算管理方法，并加强对各个国税局机关单位的预算管理和监管。